MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 15871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	GC	3	6	8	13	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017267	CAGC	2	8	16	23	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017267	GAT	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017267	CCA	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017267	AGT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017267	CAC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017267	GTT	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017267	TTG	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017267	CTG	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017267	GC	3	6	2943	2948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017267	CGC	2	6	2973	2978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017267	TC	3	6	3011	3016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017267	CGA	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017267	CG	4	8	3107	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017267	AGGT	2	8	3199	3206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017267	AC	3	6	3221	3226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017267	ATC	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017267	AC	3	6	3432	3437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017267	CG	3	6	3514	3519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017267	AAT	2	6	3538	3543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017267	TGG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017267	GTT	3	9	3596	3604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017267	TGT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017267	CCA	2	6	7494	7499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017267	CGGTG	2	10	7536	7545	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017267	GAC	2	6	7553	7558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017267	GCGCGT	2	12	8494	8505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017267	CGG	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017267	G	6	6	8572	8577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017267	GCCT	2	8	9451	9458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017267	CTG	2	6	9466	9471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017267	CGG	2	6	9643	9648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017267	TGC	2	6	10934	10939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017267	ATC	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017267	AAC	2	6	11020	11025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017267	CACTG	2	10	11117	11126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017267	TCA	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017267	CA	4	8	11746	11753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017267	CAACA	2	10	13436	13445	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017267	T	7	7	13484	13490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017267	TGT	2	6	13496	13501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017267	GCGA	2	8	13573	13580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017267	GCT	2	6	13583	13588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017267	GCA	2	6	13620	13625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017267	CG	3	6	13647	13652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017267	GC	3	6	13669	13674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017267	GGC	2	6	14779	14784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017267	GCC	2	6	16310	16315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017267	TGC	2	6	16349	16354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017267	CG	3	6	16370	16375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017267	CAA	2	6	16404	16409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017267	GCA	2	6	16490	16495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017267	TGA	3	9	16516	16524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017267	CAG	2	6	16541	16546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017267	CAC	2	6	16742	16747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017267	AGC	2	6	16760	16765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017267	TCG	2	6	16804	16809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017267	TGTT	2	8	16859	16866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017267	GGC	2	6	16912	16917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017267	GACCT	2	10	16963	16972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017267	TGC	2	6	17994	17999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017267	CGG	2	6	18034	18039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017267	TTG	2	6	18086	18091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017267	T	6	6	18117	18122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017267	AGT	2	6	18339	18344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017267	AGG	2	6	19234	19239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017267	ATGG	2	8	19240	19247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017267	TCGC	2	8	19253	19260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017267	TTG	2	6	19316	19321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017267	GGT	2	6	19428	19433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017267	AC	3	6	19450	19455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017267	TGCC	2	8	19793	19800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017267	GGC	2	6	20081	20086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017267	GCC	2	6	20093	20098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017267	GT	3	6	20107	20112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017267	CGA	2	6	20115	20120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017267	GTC	2	6	20272	20277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017267	ATTC	2	8	20318	20325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017267	TTG	2	6	20335	20340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017267	GGTG	2	8	20358	20365	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017267	TTG	2	6	20372	20377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017267	CTG	2	6	20378	20383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017267	CGTT	2	8	20422	20429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017267	CTC	2	6	23177	23182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017267	GCG	2	6	23191	23196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017267	AAT	2	6	27379	27384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017267	TGGG	2	8	28782	28789	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017267	TCA	2	6	28825	28830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017267	GC	3	6	28848	28853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017267	CCA	2	6	28911	28916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017267	GCCC	2	8	28999	29006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_017267	CGA	3	9	29105	29113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017267	GCG	2	6	29152	29157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017267	GCG	2	6	29191	29196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017267	ACG	2	6	29197	29202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017267	GGC	2	6	29400	29405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017267	GGT	2	6	29427	29432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017267	ACG	2	6	29435	29440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017267	GGT	2	6	29454	29459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017267	TGCG	2	8	31159	31166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017267	GCC	2	6	31390	31395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017267	TTCG	2	8	31421	31428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017267	CGC	2	6	31514	31519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017267	CCA	2	6	31529	31534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017267	GCT	2	6	31581	31586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017267	TTC	2	6	31660	31665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017267	GGT	2	6	31674	31679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017267	ACGC	2	8	31805	31812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017267	ACC	2	6	31837	31842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017267	GC	3	6	31894	31899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017267	AAG	2	6	31900	31905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017267	TGC	2	6	31910	31915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017267	ATGCGC	2	12	31994	32005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017267	CAG	2	6	32092	32097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017267	GC	3	6	32136	32141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017267	GTT	2	6	32148	32153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017267	ACAA	2	8	32171	32178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017267	GCAAGG	2	12	32219	32230	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017267	AGC	2	6	32233	32238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017267	GC	3	6	32278	32283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017267	GC	4	8	32300	32307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017267	ACG	2	6	32327	32332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017267	GCTG	2	8	32340	32347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017267	GC	3	6	32362	32367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017267	GCT	2	6	32370	32375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017267	ACG	2	6	32484	32489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017267	ACG	2	6	32508	32513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017267	TGCAC	2	10	32595	32604	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017267	GCT	2	6	32640	32645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017267	GGT	2	6	32679	32684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017267	GC	3	6	32689	32694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017267	CAT	2	6	32712	32717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017267	CCA	2	6	32722	32727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017267	TGC	2	6	34321	34326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017267	CCA	2	6	34330	34335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017267	CGT	2	6	34361	34366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017267	ACCGC	2	10	34372	34381	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017267	GAC	2	6	34416	34421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017267	AC	3	6	34425	34430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017267	CA	3	6	34501	34506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017267	CGGC	2	8	34655	34662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017267	CGA	2	6	34667	34672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017267	GCT	2	6	34700	34705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017267	GC	3	6	34710	34715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017267	CGG	2	6	34760	34765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_017267	A	7	7	35819	35825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017267	GCG	2	6	51430	51435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017267	CGTG	2	8	51445	51452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
282	NC_017267	TGCG	2	8	51522	51529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
283	NC_017267	GT	3	6	51554	51559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017267	CGT	2	6	51595	51600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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